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利用Pearson相关系数定量分析生物亲缘关系OA北大核心CSCD

Quantitative Analysis of the Relationship of Biology Species Using Pearson Correlation Coefficient

中文摘要

论文主要利用计算语言学中使用的统计学方法定量分析生物物种的亲缘关系.以包含生物体遗传信息的核酸序列为研究对象,采用计算语言学的思想和方法,将每一个生物体的核酸序列看作一篇很长的自然语言文本,抽取核酸序列的双核苷酸频率分布特征向量,用以表征其数字特征.而后采用Pearson Correlation Coefficient(Pearson相关系数)定量分析其亲缘关系的远近程度.将119个细菌的全基因组核酸序列进行两两比对,对所得的7 021个r值进行…查看全部>>

张宇镭;党琰;贺平安

上海交通大学生命科学与技术学院,上海,200240上海交通大学计算机科学与工程系,上海,200240复旦大学理论生命科学研究中心,上海,200433

信息技术与安全科学

Pearson相关系数核酸序列自然语言文本

《计算机工程与应用》 2005 (33)

79-82,99,5

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