分子动力学模拟的优化与并行研究OA北大核心CSCD
Research of Optimization and Parallelization for Molecular Dynamics Simulation
分析讨论了分子动力学模拟的算法特征和计算特点,对串行程序作了优化,并使之适合于作并行化.对模拟体系使用区域分解的方法,在计算节点间保留了部分重叠区域,采用基于消息传递的MPI设计平台,在可扩展机群上实现了并行化,获得了90%以上的并行效率.
张勤勇;蒋洪川;刘翠华
西华大学,材料学院,四川,成都,610039电子科技大学,微电子与固体电子学院,四川,成都,610054电子科技大学,微电子与固体电子学院,四川,成都,610054
信息技术与安全科学
分子动力学模拟优化并行
《计算机应用研究》 2005 (8)
84-85,91,3
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