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基于傅里叶分析的蛋白质编码区预测中功率谱密度计算方法研究

马玉韬 车进 刘大铭

宁夏大学学报(自然科学版)2011,Vol.32Issue(2):134-138,5.
宁夏大学学报(自然科学版)2011,Vol.32Issue(2):134-138,5.

基于傅里叶分析的蛋白质编码区预测中功率谱密度计算方法研究

Study on Power Spectrum Density Computation Methods for Protein Coding Regions Prediction

马玉韬 1车进 2刘大铭1

作者信息

  • 1. 宁夏大学物理电气信息学院,宁夏银川750021
  • 2. 天津大学电子信息工程学院,天津300072
  • 折叠

摘要

Abstract

A widely used algorithm called traditional periodogram (TP) has been applied in experiments of prediction of protein coding regions. Then a new algorithm of power spectrum density (PSD) computation called multi-sliding-window periodogram (MSWP) is proposed and used in the experiments. Measured with approximate correlation (AC) for overall prediction accuracy, the new algorithm has outperformance comparing with the other TP based Fourier analysis gene prediction algorithms by taking HMR195 and ALLSEQ (also called BG570) as test datasets.

关键词

傅里叶分析/周期图/功率谱密度计算/多滑动窗/蛋白质编码区预测

Key words

Fourier analysis/ periodogram/ power spectrum density computation/ multi-sliding windows/ protein coding regions prediction

分类

信息技术与安全科学

引用本文复制引用

马玉韬,车进,刘大铭..基于傅里叶分析的蛋白质编码区预测中功率谱密度计算方法研究[J].宁夏大学学报(自然科学版),2011,32(2):134-138,5.

基金项目

宁夏自然科学基金资助项目(NZ1024) (NZ1024)

宁夏大学学报(自然科学版)

OACHSSCDCSTPCD

0253-2328

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