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改进的免疫粒子群优化算法预测RNA二级结构

林娟 钟一文

计算机工程与应用2012,Vol.48Issue(1):40-43,75,5.
计算机工程与应用2012,Vol.48Issue(1):40-43,75,5.DOI:10.3778/j.issn.1002-8331.2012.01.012

改进的免疫粒子群优化算法预测RNA二级结构

Improved immune particle swarm optimization algorithm for RNA secondary structure prediction.

林娟 1钟一文1

作者信息

  • 1. 福建农林大学计算机与信息学院,福州350002
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摘要

Abstract

Based on SetPSO algorithm, an improved immune particle swarm optimization algorithm is designed for the RNA secondary . Prediction problem. The SetPSO algorithm is easy to fall into local optimum. According to the characteristics of RNA folding, an immune memory operator is used to tackle this shortage and increase the diversity of particle swarm. Simulation results show that the improved algorithm can get better prediction accuracy in shorter time.

关键词

核糖核酸(RNA)二级结构预测/粒子群优化/免疫记忆算子

Key words

Ribonucleic Acid(RNA) secondary structure prediction/particle swarm optimization/immune memory operator

分类

信息技术与安全科学

引用本文复制引用

林娟,钟一文..改进的免疫粒子群优化算法预测RNA二级结构[J].计算机工程与应用,2012,48(1):40-43,75,5.

基金项目

福建省自然科学基金(No.2008J0316) (No.2008J0316)

福建农林大学青年教师科研基金(No.2010018). (No.2010018)

计算机工程与应用

OACSCDCSTPCD

1002-8331

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