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秦艽HMGR基因家族的克隆及序列分析

郑鹏 化文平 王喆之

陕西师范大学学报:自然科学版2012,Vol.40Issue(6):67-72,6.
陕西师范大学学报:自然科学版2012,Vol.40Issue(6):67-72,6.

秦艽HMGR基因家族的克隆及序列分析

Cloning and characterization of HMGR genes from Gentiana macrophylla

郑鹏 1化文平 2王喆之1

作者信息

  • 1. 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室;西北濒危药材资源开发国家工程实验室;陕西师范大学生命科学学院,陕西西安710062
  • 2. 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室;西北濒危药材资源开发国家工程实验室;陕西师范大学生命科学学院,陕西西安710062 陕西学前师范学院生物科学与技术系,陕西西安710100
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摘要

Abstract

Gentiopicroside, a secoiridoid glycoside, is one of the main pharmacological compounds of traditional Chinese medicine Gentiana. In this study, two Gentiana macrophylla HMGR genes were cloned based on our laboratory's high-throughput sequencing, and bioinformatics analysis was carried out. The results showed that two HMGR genes both contain the completed ORF, and their encoded proteins with two transmembrane domains and four HMGR protein-specific conserved active sites, high consistency with the other plant in HMGR protein sequences and high structure, but GrnHMGR1 and GmHMGR2 locate respectively in the cell plasma membrane and mitochondria, Quantitative PCR analysis showed that GmHMGRI has high expression levels in the roots and flowers in G. macrophylla, while GmHMGR2 mainly expresses in leaves.

关键词

秦艽/3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)/高通量测序/序列分析

Key words

Gentiana macrophylla/3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA reductase(HMGR)/high- throughput sequencing/sequence analysis

分类

生物科学

引用本文复制引用

郑鹏,化文平,王喆之..秦艽HMGR基因家族的克隆及序列分析[J].陕西师范大学学报:自然科学版,2012,40(6):67-72,6.

基金项目

基金项目:国家自然科学基金资助项目 ()

陕西省教育厅科研项目 ()

陕西学前师范学院科研项目(2012KJ044). ()

陕西师范大学学报:自然科学版

OA北大核心CSCDCSTPCD

1672-4291

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