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常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰

张丽娜 荣昌鹤 何远 关琼 何彬 朱兴文 刘佳妮 陈红菊

动物学研究2013，Vol.34Issue(6)：640-650,11.
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动物学研究2013，Vol.34Issue(6)：640-650,11.DOI:10.11813/j.issn.0254-5853.2013.6.0640

常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰

A bird's eye view of the algorithms and software packages for reconstructing phylogenetic trees

张丽娜 1荣昌鹤 2何远 1关琼 3何彬 3朱兴文 1刘佳妮 3陈红菊4

作者信息

  • 1. 大理学院数学与计算机学院,云南大理671003
  • 2. 云南林业职业技术学院,云南昆明650224
  • 3. 中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,计算生物学与医学生态学研究组,云南昆明650223
  • 4. 红河学院,云南蒙自661100
  • 折叠

摘要

关键词

系统发育树/距离矩阵法/最大简约法/最大似然法/贝叶斯算法/系统发育分析软件

Key words

Phylogenetic tree/ Distance matrix/ Maximum parsimony/ Maximum likelihood/ Bayesian framework/ Phylogenetic analysis software

分类

生物科学

引用本文复制引用

张丽娜,荣昌鹤,何远,关琼,何彬,朱兴文,刘佳妮,陈红菊..常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰[J].动物学研究,2013,34(6):640-650,11.

基金项目

遗传资源与进化国家重点实验室“开放课题”(项目名称:利用生存分析改进系统发育树和溯祖树构建的准确性和可靠性,项目编号:GREKF11-11) （项目名称:利用生存分析改进系统发育树和溯祖树构建的准确性和可靠性,项目编号:GREKF11-11）

动物学研究

OACSCDCSTPCDMEDLINE

0254-5853

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