2个银叶真藓HSP70序列的生物信息学相关分析OA
Bioinformatics relevant analysis of two heat shock protein 70 sequence from Bryum argenteum
从银叶真藓（Bryum argenteum）转录组数据库出发，使用Pfam数据库提供的HMM模型共得到33条长度大于200aa，注释的热休克蛋白BaHSP70；其中2条（BaHSP70⁃1， BaHSP70⁃2）具有完整ORF，NCBI核酸数据库登录号为KP087877和KP087878。使用生物信息学在线分析工具和软件，对真藓HSP70的两条蛋白质序列从氨基酸组成、保守结构域、理化性质、疏水性／亲水性、信号肽、蛋白质结构、模体的识别及同源性分析…查看全部>>
Our study utilizes the RNA⁃seq technology which is based on the Hi⁃seq 2000 sequencing platform from BGI to acquire the RNA sequences data from Bryum argenteum dealt with dehydration and rehydration stress. Using the Hidden Markov Model provided by the Pfam database, we have identified 33 HSP70 sequences with the length longer than 200aa. Two of them ( BaHSP70⁃1,BaHSP70⁃2) contain Open Reading Frame, the Accession No. in NCBI nucleotide database are KP087877…查看全部>>
王明强;高贝;张道远
中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室，中国科学院新疆生态与地理研究所，乌鲁木齐830011 中国科学院大学，北京100049中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室，中国科学院新疆生态与地理研究所，乌鲁木齐830011
生物科学
真藓热激蛋白70RNA-Seq生物信息学
Bryum argenteumHeat shock protein 70RNA-SeqBioinformatics
《生物信息学》 2015 (1)
1-8,8
NSFC－新疆青年人才联合项目（ U1403302）。
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