黄瓜共表达基因模块的识别及其特点分析OA北大核心CSCDCSTPCD
Identification and Characterization Analysis of Co-expression Gene Modules in Cucumber (Cucumis sativus L.)
共表达网络分析是利用海量生物学数据研究基因与性状关系的重要方法.本研究利用黄瓜(Cucumis sativus L.)10份不同组织的转录组数据计算各个基因在不同组织中表达丰度,去除在10个组织中表达量最大值小于5的基因,然后利用R语言中的权重共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)软件包构建了共表达网络,获得1 134个共表达模块,一共16 924个基因.去除模块内基…查看全部>>
林行众;张忠华;杨清;黄三文
南京农业大学生命科学学院,南京210095中国农业科学研究院蔬菜花卉研究所/农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室/中-荷园艺作物基因组分析实验室,北京100081中国农业科学研究院蔬菜花卉研究所/农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室/中-荷园艺作物基因组分析实验室,北京100081南京农业大学生命科学学院,南京210095
黄瓜转录组权重共表达网络分析(WGCNA)共表达
CucumberTranscriptomeWeighted gene co-expression network analysis (WGCNA)Coexpression
《农业生物技术学报》 2015 (9)
蔬菜种质资源与遗传育种学
1121-1130,10
国家重点基础研究发展计划(973)项目(No.2012CB113900)、国家自然科学基金(No.31225025、No.31322047和No.11171155)和中国农业科学院科技创新工程
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