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序列比对算法中的BW变换索引技术研究及其改进

赵雅男徐云程昊宇

计算机工程2016，Vol.42Issue(1)：282-286,5.

计算机工程2016，Vol.42Issue(1)：282-286,5.DOI:10.3969/j.issn.1000-3428.2016.01.050

序列比对算法中的BW变换索引技术研究及其改进

Research on BW Transform Index Technology in Sequence Alignment Algorithm and Its Improvement

赵雅男 ¹徐云 ²程昊宇¹

作者信息

1. 中国科学技术大学计算机科学与技术学院,合肥230027
2. 安徽省高性能计算重点实验室,合肥230027
折叠

摘要

关键词

序列比对/索引/BW变换索引/第二代测序/第三代测序/大规模长序列比对

Key words

sequence alignment/index/Burrows-Wheeler Transform (BWT) index/next-generation sequencing/third-generation sequencing/alignment of large-scale and long sequences

分类

信息技术与安全科学

引用本文复制引用

赵雅男,徐云,程昊宇..序列比对算法中的BW变换索引技术研究及其改进[J].计算机工程,2016,42(1):282-286,5.

基金项目

国家自然科学基金资助重点项目(61033009) （61033009）

国家“111”计划基金资助项目(B07033). （B07033）

计算机工程

OA北大核心CSCDCSTPCD

ISSN：1000-3428

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