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籼粳稻基因组295个InDel标记的开发OA北大核心CSCDCSTPCD

Development of 295 InDel Markers for Indica and Japanica Rice

中文摘要英文摘要

插入/缺失(InDel)分子标记具有使用简单,结果清晰可靠的优点。本研究通过比对粳稻品种日本晴和籼稻品种93-11的基因组序列,在全基因组范围内设计了634对InDel候选标记,通过PCR检测比较2种粳稻(日本晴和台中65)和2种籼稻(93-11和黄华占)的多态性,发现295对标记在2种籼稻间及2种粳稻间均带型一致,而在籼、粳亚种间有多态性,因此这套295对标记可以在涉及籼粳亚种的基因定位和分子育种中应用。

Insertion/Deletion (InDel) markers have advantages of simplicity and reliability for genotyping. We selected 634 can-didate InDel markers distributing throughout the 12 chromosomes of rice by comparing genome sequences between the japonica cultivar Nipponbare and the indica cultivar 93-11. PCR results of these candidate markers between two japonica (Nipponbare and Taizhong 65) and two indica (93-11 and Huanghuazhan) cultivars revealed that 295 InDel markers …查看全部>>

初志战;郭海滨;曾栋昌;刘耀光

华南农业大学生命科学学院 / 亚热带农业生物资源保护与利用重点实验室,广东广州 510642华南农业大学公共基础课实验教学中心,广东广州 510642华南农业大学生命科学学院 / 亚热带农业生物资源保护与利用重点实验室,广东广州 510642华南农业大学生命科学学院 / 亚热带农业生物资源保护与利用重点实验室,广东广州 510642

InDel标记水稻基因定位

InDel markerRiceGene mapping

《作物学报》 2016 (6)

932-941,10

本研究由亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室开放课题(SKL-CUSAb-2013-04)和广东省自然科学基金-博士启动项目(2015A030310485)资助。This study was supported by the Open Fund Project of State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources (SKL-CUSAb-2013-04) and the Natural Science Fund of Guangdong Province-the Launch Program for Doctor (2015A030310485)

10.3724/SP.J.1006.2016.00932

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