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基于RNA-seq的杜氏盐藻全转录组测序与分析OA北大核心CSTPCD

Transcriptome sequencing and analysis of Dunaliella salina based on RNA-seq

中文摘要

目的:利用RNA-seq技术对杜氏盐藻细胞的全部转录本进行测序、功能分析.方法:提取杜氏盐藻总RNA,反转录得cDNA,在Illumina平台上进行测序,经拼接、组装、聚类后获得全部unigene,并将所得unigene与数据库比对,对其进行功能注释和分类.结果与结论:共得到197 295个unigene,将获得的unigene与NR、SWISS-PROT、CDD、KEGG和TREMBI数据库进行比对,有89 800个unigene获得注释.其中…查看全部>>

朱立强;李庆华;张彦婷;朱相展;关方霞;薛乐勋

郑州大学第二附属医院检验科 郑州450014郑州大学生命科学学院 郑州450001郑州大学生命科学学院 郑州450001郑州大学生命科学学院 郑州450001郑州大学生命科学学院 郑州450001郑州大学生命科学学院 郑州450001

生物科学

杜氏盐藻转录组RNA-seq

Dunaliella salinatranscriptomeRNA-seq

《郑州大学学报(医学版)》 2016 (3)

289-293,5

科技部国际科技合作基金资助项目 2007DFA01240河南省高等学校重点科研项目 15A310028,15A180022

10.13705/j.issn.1671-6825.2016.03.001

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