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胃癌相关基因的生物信息学分析及蛋白互作网络构建OA

Bioinformatics Analysis of Gastric Cancer Related Gene and Protein-Protein Interaction Network Construction

中文摘要英文摘要

目的:分析胃癌和癌旁组织间差异表达基因的功能及其编码蛋白的相互作用,筛选出胃癌相关的关键基因。方法从NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)下载胃癌基因芯片数据GSE79973,采用R Bioconductor3.2.4软件对数据进行处理和分析,输出差异表达基因,并通过生物信息学工具DAVID、String、Cytoscape 对差异表达基因进行生物学功能及其编码蛋白的互作分析。结果…查看全部>>

Objective Analyzing the function of differentially expressed genes between gastric cancer and adjacent tissues and the interactions of their encoded proteins , Selecting key genes associated with gastric cancer .Methods Microar-ray data of gastric cancer GSE 79973 was downloaded from GEO ( Gene Expression Omnibus ) database of NCBI ( National Center for Biotechnology Information ).Using R Bioconductor 3.2.4 software for data processing and analysis , and the…查看全部>>

罗远卫;梁敏;石波云;牛秋玲;刘兆宇;周新科

广州医科大学附属第五医院 广东广州 510700广州医科大学附属第五医院 广东广州 510700广州医科大学附属第五医院 广东广州 510700广州医科大学附属第五医院 广东广州 510700广州医科大学附属第五医院 广东广州 510700广州医科大学附属第五医院 广东广州 510700

医药卫生

胃癌基因芯片差异表达基因生物信息学

Gastric CancerMicroarrayDifferentially Expressed GenesBioinformatics

《现代医院》 2016 (10)

1418-1422,1426,6

广东省教育厅特色创新类项目(编号2015 KTSC0110),广东省教育厅青年创新人才类项目(编号2015KQNCX127),广州市科创委2014年科技惠民专项项目(编号2014Y2-00092),广州市健康医疗协同创新重大专项二期拟立项项目(编号201508020262)

10.3969/j.issn.1671-332X.2016.10.004

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