基于银鲳RNA－seq数据中SR标记的信息分析OA
Bioinformatic Analysis of SSR Markers Based on RNA-seq of Pampus argenteus
[目的]开发银鲳分子标记技术。[方法]通过对银鲳（Pampus argenteus）进行高通量转录组测序（RNA－seq ）获得银鲳转录组原始试验数据，经过拼接后，获得3715603条unigene序列。采用生物信息学分析软件MISA对所有unigene进行简单重复序列（ simple se-quence repeat，SSR）位点鉴定。同时，利用软件对银鲳转录组SSR的多态性进行评价。[结果]银鲳转录组水平上，共鉴定出107007个SSR位点，…查看全部>>
Objective] To develop molecular marker technology of Pampus argenteus.[Method] Transcriptomic sequencing was performed for molecular marker technology development on Pampus argenteus, and 3 715 603 unigene was found after assembling.The Microsatellite ( MISA) software was used to identify SSRs from unigenes.Meanwhile, SSR polymorphisms were evaluated using software.[ Result] 107 007 SSRs were identified, distributed in 97 289 unigenes, which accounted for 2.…查看全部>>
刘磊;彭士明;高权新;张晨捷;施兆鸿
中国水产科学研究院东海水产研究所，农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室，上海200090 上海海洋大学水产与生命学院，上海201306中国水产科学研究院东海水产研究所，农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室，上海200090中国水产科学研究院东海水产研究所，农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室，上海200090中国水产科学研究院东海水产研究所，农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室，上海200090
农业科技
银鲳转录组测序SSR标记
Pampus argenteusRNA-seqSSR marker
《安徽农业科学》 2016 (28)
102-105,4
中央级公益性科研院所基本科研业务费项目（东2014Z02－3）；国家科技支撑项目（2011BAD13B01）。
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