大口黑鲈转录组SNPs筛选及其与生长的关联分析OA北大核心CSCDCSTPCD
SNPS IDENTIFICATION IN RNA-SEQ DATA OF LARGEMOUTH BASS (MICROPTERUS SALMOIDES) FED ON FORMULATED FEED AND ASSOCIATION ANALYSIS WITH GROWTH TRAIT
为开发人工饲料代替冰鲜杂鱼养殖大口黑鲈的分子标记,以食用冰鲜鱼和配合饲料的同批大口黑鲈为研究材料,利用RNA-Seq (RNA sequencing)技术挖掘SNPs (Single nucleotide polymorphisms)标记,并以关联分析筛选可用于育种的候选标记。转录组进行测序共获得174 M数据,8681个SNPs位点。挑选其中具有表达差异的50个SNPs位点进行SNaPshot分型,结果39个分型成功,其中有4个为假阳性,通过转…查看全部>>
It is a hot research area to substitute frozen trash fish (FF) with artificial compound diet (CD) in feeding the carnivorous economic fish. Largemouth bass (Micropterus salmoides) is one of the important aquaculture species with an annual output of about 340000 tons in fresh water in China. Effect of artificial compound diet at the transcriptome level of largemouth bass is rare reported. The current study utilized RNA-Seq (RNA sequencing) technology on the I…查看全部>>
全迎春;马冬梅;白俊杰;刘浩;李胜杰;刘海涌
中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广州 510380中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广州 510380中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广州 510380中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广州 510380中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广州 510380中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广州 510380
生物科学
转录组测序(RNA-Seq)大口黑鲈单核苷酸多态(SNPs)生长性状
RNA sequencing (RNA-Seq)Largemouth bassSingle nucleotide polymorphisms (SNPs)Growth trait
《水生生物学报》 2016 (6)
食植物蛋白大口黑鲈的基因表达特征
1128-1134,7
农业部948项目(2011-G12)广东省省级科技计划(2015A020209035)国家自然科学基金(31001107,31201985)资助[Supported by the “948” Project of Ministry of Agriculture of China (2011-G12) Science and Technology Planning Project of Guangdong Province (2015A020209035) National Natural Science Foundation of China (31001107,31201985)
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