基于高通量测序技术的实验动物沙门氏菌检测方法的建立与评价OA北大核心CSTPCD
Establishment and evaluation of a high throughput sequencing technology for detection of Salmonella in laboratory animals
目的：建立基于高通量测序技术的实验动物沙门氏菌检测方法，应用于实验动物沙门氏菌的检测。方法提取小鼠粪便DNA样本，分别针对16S rDNA区域、23S rDNA区域、16S～23S rDNA IS、23S～5S rDNA IS、gyrB优选区域设计通用引物，对各个引物进行测试分析，优化扩增条件并建库，利用Illumina高通量测序技术检测区分42个样本中的沙门氏菌，评价该方法的特异性和稳定性。结果筛选发现沙门氏菌的菌种分类优选区域为gyrB基因，…查看全部>>
Objective To establish a detection method of Salmonella in laboratory animals based on a high-throughput sequencing technology, and to apply it in detection of Salmonella in laboratory animals.Methods DNA samples were extracted from mouse feces.Universal primers for 16S rDNA, 23S rDNA, 16S-23S rDNA, 23S-5S rDNA region, gyrB preferred area were designed, respectively.Each primer was tested and analyzed to determine the best amplification conditions and build …查看全部>>
胡毅翔;张欢欢;余陈欢;金晓音;应华忠
浙江省医学科学院浙江省实验动物与安全性研究重点实验室，杭州 310013浙江省医学科学院浙江省实验动物与安全性研究重点实验室，杭州 310013浙江省医学科学院浙江省实验动物与安全性研究重点实验室，杭州 310013浙江省医学科学院浙江省实验动物与安全性研究重点实验室，杭州 310013浙江省医学科学院浙江省实验动物与安全性研究重点实验室，杭州 310013
医药卫生
沙门氏菌实验动物高通量测序
SalmonellaLaboratory animalHigh-throughput sequencing
《中国比较医学杂志》 2016 (10)
72-78,7
浙江省卫生高层次人才（2012F30026），浙江省科技厅院所专项（2016F30001）。