基于蛋白质互作网络的鼻咽癌基因模块化分析OACSTPCD
Gene module analysis of nasopharyngeal carcinoma based on protein-protein interaction network
目的:基于蛋白质互作网络,筛选调节鼻咽癌的基因模块,为鼻咽癌的分子诊断和治疗提供新的靶点。方法利用 GEO 数据库中鼻咽癌的数据集(GSE12452)和 SAM软件,筛选鼻咽癌中差异表达基因。利用 String 数据库,建立鼻咽癌中差异表达基因的蛋白质互作网络。基于构建的网络,利用生物信息学模块化分析方法筛选在鼻咽癌发生发展过程中起重要作用的基因模块。根据 DAVID 数据库,对模块进行 GO 分析,挖掘模块的调控功能。结果本次研究中共筛选出在鼻…查看全部>>
Objective Based on protein-protein interaction network,gene modules were identified to provide new targets for molecular therapy of nasopharyngeal carcinoma.Methods GEO dataset (GSE12452)and SAMsoftware were employed to screen the differentially ex-pressed gene in nasopharyngeal carcinoma.Protein-protein interaction network was established by using String database.Based on the net-work,the gene modules were identified by using bioinformatics gene modul…查看全部>>
张姝;崔晓波;孙娟
内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科,内蒙古 呼和浩特010050内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科,内蒙古 呼和浩特010050内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科,内蒙古 呼和浩特010050
医药卫生
鼻咽癌蛋白质互作网络基因模块化分析
nasopharyngeal carcinomaprotein-protein interaction networkgene module analysis
《局解手术学杂志》 2016 (11)
781-783,784,4
内蒙古自治区自然科学基金(2014MS0856);内蒙古医科大学科技百万工程项目(KJbw2013014)
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