基于高通量测序组装'赤霞珠'叶绿体基因组及其特征分析OA北大核心CSCDCSTPCD
Assembling and Characteristic Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Vitis vinifera cv. Cabernet Sauvignon from High-Throughput Sequencing Data
[目的]以欧亚种葡萄'赤霞珠'(Cabernet Sauvignon)为试材,建立适于葡萄属(Vitis)植物完整叶绿体基因组组装及其特征分析的方法,为研究葡萄属植物的进化和系统发育提供方法指导.[方法]采用Illumina HiSeq PE150双末端测序策略对其全基因组DNA建库测序,建库类型为350 bp DNA小片段文库,测序深度为10倍.以已发表的拟南芥(Arabidopsis thaliana)和欧亚种葡萄'黑比诺'(Pinot No…查看全部>>
[Objective]A method was built to assemble complete chloroplast (cp) genome of Vitis and analyze its characteristics with Vitis vinifera cv. Cabernet Sauvignon, which will provide a methodological guidance for evolution and phylogenetic analysis of Vitis in the future.[Method]Total genomic DNA was extracted from young leaves of Cabernet Sauvignon using plant genomic DNA kit. The small fragments (350 bp) of DNA libraries were constructed according to the manuf…查看全部>>
谢海坤;焦健;樊秀彩;张颖;姜建福;孙海生;刘崇怀
中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009
'赤霞珠'叶绿体基因组高通量测序特征分析系统发育分析
Cabernet Sauvignonchloroplast genomehigh-throughput sequencingcharacteristic analysisphylogenetic analysis
《中国农业科学》 2017 (9)
1655-1665,11
国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-30-yz-1)、中国农业科学院科技创新工程专项(CAAS-ASTIP-2015-ZFRI)、农业部物种保护项目(2130135-34)
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