生物信息学方法研究高脂饮食诱导肥胖对雄性SD大鼠的影响OACSTPCD
Effects of high-fat diet induced obesity on SD male rat by using bioinformatics analysis
目的 应用生物信息学方法探寻高脂饮食诱导性肥胖雄性SD大鼠生理代谢改变及对生育力的影响. 方法 利用NCBI中的GEO基因芯片公共数据库进行芯片数据搜索,最终选择芯片数据(GSE8700)作为分析对象,使用bioconductor包中R工具的函数及Limma程序包识别差异性表达基因,应用DAVID数据库对差异表达基因进行GO富集分析和KEGG通路分析,选用String在线数据库构建差异表达基因的PPI网络. 结果 通过对GSE8700进行分析,得…查看全部>>
Objective: To investigate the effect of high-fat diet induced obesity on physiological metabolism and fertility in SD male rats.Methods: By using GEO gene chip common database in NCBI for chip data search,finally the chip data(GSE8700) was selected as the analysis object.The differentially expressed genes(DEGs) were identified by using R software in the bioconductor package and the Limma package.GO enrichment and KEGG pathway analysis were performed using DA…查看全部>>
贾艳飞;郭颖;张蔚;张开舒;傅龙龙;安琪;童越;谷翊群
北京协和医学院研究生院,北京 100730国家卫生计生委科学技术研究所,北京 100081国家卫生计生委科学技术研究所,北京 100081北京协和医学院研究生院,北京 100730国家卫生计生委科学技术研究所,北京 100081北京协和医学院研究生院,北京 100730国家卫生计生委科学技术研究所,北京 100081北京协和医学院研究生院,北京 100730
生物信息学肥胖生殖差异基因
Bioinformatics analysisObesityReproductionDifferentially expressed gene
《生殖医学杂志》 2017 (8)
820-826,7
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