蒙古马小RNA高通量测序分析OA北大核心CSCDCSTPCD
High Throughput Sequencing Analysis of miRNA of Mongolian Horse (Equus caballus)
miRNA(microRNA)是重要的转录后调控因子,在很多物种中己获得鉴定,然而对马(Equus caballus)的miRNA相关研究较少.本研究应用Solexa测序技术对蒙古马的8个组织混合样小RNA进行测序并做了相关的生物信息学分析.结果得到5 199 802个小RNA纯净序列(clean reads),经过长度分布统计和分类注释后,将其与miRBase数据库比对鉴定马的239个保守miRNA.同时,用Mireap软件预测出510个…查看全部>>
miRNA (micoRNA) is a very important post transcriptional regulatory factor,and have been identified in many species,whereas miRNA related studies were poor in horse (Equus caballus).In this study,we carried out small RNA sequencing on mixed sample of 8 tissues of Mongolian horse with Solexa sequencing technology and analysed expression abundance of conserved and candidate miRNA,and predicted their target genes with relevant bioinformatic analysis.5 922 735 c…查看全部>>
萨如拉;白东义;陶克涛;赵一萍;任秀娟;阿娜尔;鲍红梅;黄金龙;芒来
内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018内蒙古农业大学动物科学学院/内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室,呼和浩特010018
农业科技
蒙古马miRNA高通量测序靶基因预测
Mongolian horseMiRNA, High throughput sequencingTarget prediction
《农业生物技术学报》 2017 (4)
构建马亚属动物泛基因组序列图谱
614-620,7
国家自然科学基金项目(No.31360538)、国家自然科学基金项目(No.31472070)和内蒙古自治区科技厅重点实验室建设项目(No.20130902)
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