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牦牛miR-101的靶基因预测及生物信息学分析OA北大核心CSTPCD

Bioinformatic Analysis and Prediction of miRNA-101 Target Genes in Yak

中文摘要英文摘要

本研究利用相关生物信息学软件和数据库对牦牛miR-101进行了靶基因预测与生物信息学分析.通过高通量测序获取牦牛miR-101的序列,并分析其序列保守性;选取TargetScan、miRanda、PicTar预测结果的交集并结合miRTarbase中已证实的靶基因集合,取二者并集,采用BINGO和DAVID数据库获得靶基因集合的本体注释,进行GO功能富集及Pathway信号通路富集分析.结果显示,miR-101序列在各物种间高度保守,miR-10…查看全部>>

In this study,bioinformatics softwares and databases were used to bioinformatically analyze and predict target genes of miR-101 in yak.The high-throughput sequencing technology was used to obtain the sequence of yak miR-101 and analyze its conservation.TargetScan,miRanda and PicTar were applied to predict target genes of miR-101.The intersection of the three results and validated targets from miRTarbase database were demonstrated by Gene Ontology and Pathway…查看全部>>

凌笑笑;吴晓云;梁春年;唐朋;王宏博;包鹏甲;郭宪;阎萍

中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州730050甘肃省牦牛繁育重点实验室,兰州730050中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州730050甘肃省牦牛繁育重点实验室,兰州730050中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州730050甘肃省牦牛繁育重点实验室,兰州730050甘肃省牦牛繁育重点实验室,兰州730050甘肃农业大学,兰州730050

生物科学

牦牛miR-101靶基因生物信息学

yakmiR-101target genesbioinformatics

《中国畜牧兽医》 2017 (9)

2580-2586,7

现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-38)中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP-2014-LIHPS-01)

10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.09.006

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