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利用ARMS-Tm-shift-qPCR技术检测水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq

陈峰 徐建第 姜明松 张全芳 朱文银 李广贤 周学标 杨连群

山东农业科学2017,Vol.49Issue(10):15-19,5.
山东农业科学2017,Vol.49Issue(10):15-19,5.DOI:10.14083/j.issn.1001-4942.2017.10.003

利用ARMS-Tm-shift-qPCR技术检测水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq

Detection of Wx-mq Gene for Low-Amylose Content by ARMS-Tm-shift-qPCR Technology

陈峰 1徐建第 1姜明松 1张全芳 2朱文银 1李广贤 1周学标 1杨连群1

作者信息

  • 1. 山东省水稻研究所,山东济南250100
  • 2. 山东省农业科学院生物技术研究中心,山东济南250100
  • 折叠

摘要

Abstract

Wx-mq gene is a low amylose trait controlled gene and closely relates with the eating quality of rice.According to the rice low amylose starch content control gene Wx-mq No.497 position existing G >A single nucleotide variants,two real-time PCR genotyping methods,ARMS and Tm-shift based on SYBR Green Ⅰ,was combined to establish the fluorescence real-time quantitative PCR system,which could accurately distinguish the GG homozygote,AA homozygote and GA heterozygosis of Wx-mq gene No.497 position.The experiment results showed that the ARMS-Tm-shift real-time PCR genotyping method based on SYBR Green Ⅰ did not need probe synthesis with simple designs.It was a rapid,simple and specific genotyping method.It could be used in high-throughput genotyping of Wx-mq gene in molecular marker assisted breeding.

关键词

水稻/Wx-mq基因/低直链淀粉含量/ARMS-Tm-shift-qPCR

Key words

Rice/Wx-mq gene/Low-amylose content/ARMS-Tm-shift-qPCR

分类

农业科技

引用本文复制引用

陈峰,徐建第,姜明松,张全芳,朱文银,李广贤,周学标,杨连群..利用ARMS-Tm-shift-qPCR技术检测水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq[J].山东农业科学,2017,49(10):15-19,5.

基金项目

国家重点研发计划项目(2017YFD0100505) (2017YFD0100505)

国家水稻产业体系济宁综合试验站(CARS-01-60) (CARS-01-60)

国家科技支撑计划子课题(2015BAD01B02-1-3) (2015BAD01B02-1-3)

山东省水稻产业体系项目(SDAIT-17-01) (SDAIT-17-01)

山东省重点研发计划项目(2017GNC11111) (2017GNC11111)

山东省农业科学院科技创新重点项目(2014CXZ10-5) (2014CXZ10-5)

山东省农业科学院科技创新工程项目(CXGC2016A11) (CXGC2016A11)

山东省农业科学院重大成果培育项目(2016CGPY09) (2016CGPY09)

山东农业科学

OACSTPCD

1001-4942

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