基于糙皮侧耳转录组测序挖掘降解木本基质的候选功能基因OA北大核心CSCDCSTPCD
Detection of Candidate Genes for Degradation of Woody Substrates by Pleurotus ostreatus (Jacq.: Fr.) Kummer Based on Transcriptome Sequencing
采用Illumina HiSeq 4000 SBS高通量测序平台对糙皮侧耳[Pleurotus ostreatus (Jacq.:Fr.) Kummer]的转录组进行测序,挖掘糙皮侧耳降解木质基质的候选功能基因.共得到糙皮侧耳转录本序列64 228条,单基因序列46 417条.使用Blast工具将转录本序列比对到NR、Swissprot、KEGG、String、Pfam等数据库中,并有33 736条序列得到注释.通过对差异基因的对比和筛选,得到1…查看全部>>
魏珊珊;赫俊阳;宋倩;王建国;耿楠楠;杜亚荣;宋瑞清
东北林业大学林学院,哈尔滨150040东北林业大学林学院,哈尔滨150040东北林业大学林学院,哈尔滨150040东北林业大学林学院,哈尔滨150040东北林业大学林学院,哈尔滨150040东北林业大学林学院,哈尔滨150040东北林业大学林学院,哈尔滨150040
糙皮侧耳转录组高通量测序差异基因
《吉林农业大学学报》 2018 (2)
164-170,7
国家自然科学基金面上项目(31470648),东北林业大学本科生创新项目(201610225154)
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