基于简化基因组测序评价太湖鹅 不同保种场的保种效果OA北大核心CSCDCSTPCD
Assessment of Conservation Effects of Different Taihu Goose Conservation Farms Based on Simplified Genome Sequencing
旨在评价太湖鹅原种场和国家水禽基因库的保种效果,为进一步更好地对太湖鹅进行保种打下理论依据.利用ddRAD简化基因组测序方法鉴定太湖鹅原始群体(TS)、原种场群体(TC)和基因库群体(TK)的SNP标记,比较分析3个群体的遗传多样性差异,并使用遗传分化系数FST和核苷酸多样性π比值联合筛选选择信号区域及其相关基因,对得到的受选基因进行GO和KEGG功能富集分析.结果发现,与原始群体相比,原种场群体和基因库群体的遗传杂合度均有降低,近交系数上升,且基因库群体与原始群体、原种场群体有中度分化的趋势.原种场群体的脂类代谢相关基因受到了一定程度的选择.结果表明,原种场群体和基因库群体应适当增加保种群数量,避免近交系数上升过快,且基因库群体应加强与原种场群体的基因交流,避免与原始群体、原种场群体的过度分化.
LIU Hongxiang;ZHU Manxing;QIN Haorong;SONG Weitao;ZHU Chunhong;TAO Zhiyun;XU Wenjuan;ZHANG Shuangjie;LI Huifang
农业科技
鸭保种简化基因组测序
《华北农学报》 2018 (z1)
94-99,6
江苏现代农业(水禽)产业技术体系建设专项资金(JATS[2018]225)
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