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蛋白质功能模块检测的聚类方法综述

霍思聪 黎英

计算机工程与应用2019,Vol.55Issue(8):17-26,10.
计算机工程与应用2019,Vol.55Issue(8):17-26,10.DOI:10.3778/j.issn.1002-8331.1812-0004

蛋白质功能模块检测的聚类方法综述

Research Progress of Functional Module Detection for Protein-Protein Interaction Networks

霍思聪 1黎英2

作者信息

  • 1. 南宁师范大学 计算机与信息工程学院,南宁 530299
  • 2. 南宁师范大学 广西高校科学计算与智能信息处理重点实验室,南宁 530299
  • 折叠

摘要

Abstract

Detection of protein functional modules in Protein-Protein Interaction(PPI)networks is helpful to predict the functional modules of unknown proteins. With the rapid growth of effective data of protein interaction, how to obtain effec-tive protein functional modules through PPI network has become the biggest challenge. This paper describes the develop-ment and current situation of PPI network research, then summarizes the current detection algorithms of protein functional modules, divides them into unit clustering and multivariate clustering, and elaborates the representative methods of each category in detail. Finally, it discusses the challenges and the future research directions of the PPI network functional module detection research.

关键词

蛋白质相互作用/蛋白质功能模块/检测/聚类

Key words

protein-protein interaction/ protein function module/ detecting/ clustering

分类

信息技术与安全科学

引用本文复制引用

霍思聪,黎英..蛋白质功能模块检测的聚类方法综述[J].计算机工程与应用,2019,55(8):17-26,10.

基金项目

广东省自然科学基金(No.2016A030313703) (No.2016A030313703)

广东省交通运输厅科技项目(No.科技-2016-02-030) (No.科技-2016-02-030)

广东省科技计划项目(No.2016B030305002) (No.2016B030305002)

广东省自然科学基金(No.2016A030313713) (No.2016A030313713)

广东省科技计划产学研项目(No.2017B090901005). (No.2017B090901005)

计算机工程与应用

OA北大核心CSCDCSTPCD

1002-8331

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