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基于非结构蛋白NS1结构预测解析猪细小病毒致病性差异OA北大核心CSTPCD

Analysis of Pathogenicity Difference of PPV Based on Prediction about the Structure of the Non-structural Protein NS1

中文摘要

为了探讨猪细小病毒(Porcine parvovirus,PPV)不同毒株致病性差异的原因,利用生物信息学在线软件比较PPV NADL-2株和Kresse株的非结构蛋白NS1的氨基酸位点差异,并利用一系列在线软件比较两者的氨基酸理化性质、亲水/疏水性、跨膜区、信号肽的异同,进一步分析两者的结构域、二级结构、三级结构的异同.结果表明,2种毒株在621—636位的氨基酸存在较大差异,Kresse株的疏水性较弱,且二级结构中Kresse株含较多的卷曲结构.经过三级结构比对,并结合以上结果推测,2种毒株致病性差异是由于621—636位未知功能的结构域不同所致.

周雍;魏磊;景炳年;马艳妮;王伟

河南省科学院生物技术开发中心,河南郑州 450003河南省科学院生物技术开发中心,河南郑州 450003河南省科学院生物技术开发中心,河南郑州 450003河南省科学院生物技术开发中心,河南郑州 450003河南省科学院生物技术开发中心,河南郑州 450003

农业科技

猪细小病毒非结构蛋白NS1蛋白致病性生物信息学

《河南农业科学》 2020 (4)

138-146,9

河南省科学院杰青人才项目(190413008)河南省科学院基本科研费项目(190613032)

10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.04.020

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