拟南芥EBP1蛋白与RNA相互作用的初步研究OA北大核心CSCDCSTPCD
Preliminary Study on Interaction Between Arabidopsis thaliana EBP1 Protein and RNA
基因表达调控是现代分子生物学研究的热点话题,随着研究手段的不断成熟,其RNA转录后调控已成为备受关注的领域.RNA结合蛋白(RBPs)是转录后调控的关键因子,参与RNA可变剪切、RNA稳定、翻译等多个过程的调控.ErbB3绑定蛋白(EBP1)是结构功能高度保守的RNA结合蛋白,可与rRNA、tRNA、mRNA等多种RNA结合,参与调控核糖体生物生成、蛋白质翻译多个过程,但目前已报道的靶RNA甚少,对靶RNA的作用机制目前仍不清楚.通过生物信息学分析发现拟南芥EBP1结合RNA的保守结构域,并在体外可直接结合"GUCUCUCACUGCGACGGCUU"序列;通过RNA免疫共沉淀实验找到了3个靶mRNA(AT1G24792、AT3G25211、AT3G24320);结合核糖体提取及虫草素处理实验发现EBP1可显著调控特定靶mRNA的稳定性及其翻译速率.研究结果不仅证实拟南芥EBP1具有结合RNA的功能,还显示其参与调控靶RNA的转录后事件,为进一步研究EBP1在转录后调控的生物学机制奠定基础.
李晓燕;李驰宇;于峰;廖红东
湖南大学生物学院,长沙 410082湖南大学生物学院,长沙 410082湖南大学生物学院,长沙 410082湖南大学生物学院,长沙 410082
EBP1RNA结合蛋白mRNA稳定性和翻译
《生物技术通报》 2020 (6)
35-45,11
长沙市科技计划项目(kq1706017)
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