镉胁迫后旱柳转录组变化分析OA北大核心CSCDCSTPCD
Transcriptome Analysis of Saliz matsudana Under Cadmium Stress
随着重金属镉(Cd)应用范围的扩大,土壤Cd污染问题日益严重.以具有植物恢复潜力的旱柳(Saliz matsudana)作为研究对象,探究不同浓度的Cd胁迫后旱柳无性系1 d、7 d和30 d后基因表达与代谢通路的变化.转录组测序结果表明:共获得102595个Unigenes,相同浓度不同时间的差异基因总数为26623和32154个;相同时间不同浓度的差异基因总数为8550、3444和11428个.从中筛选得到与Cd胁迫响应密切相关的基因25个,其中金属硫蛋白、ABC转运蛋白、锌和锰转运蛋白等基因的表达不仅会随着Cd胁迫浓度变化而且同时受到胁迫时间的改变而发生改变;油菜素内酯合成通路的3,6-脱氧油菜素淄酮酶(ROT3)和黄酮类化合物合成通路的黄酮醇合成酶(FLS)、黄烷酮-3-羟化酶(F3H)均明显上调.此外旱柳响应Cd胁迫的GO条目主要集中在代谢过程、细胞过程、膜、细胞器、细胞、细胞部分、催化活化和结合蛋白上,参与这些GO条目的差异表达基因数随着Cd浓度和胁迫时间的增加而增加.通过转录组测序分析旱柳Cd胁迫后的响应机制,旨为旱柳修复土壤Cd污染提供理论指导.
曹继敏;李双财;何德
西南林业大学生命科学学院,昆明 650224西南林业大学生命科学学院,昆明 650224西南林业大学生命科学学院,昆明 650224
旱柳镉转录组差异基因
《生物技术通报》 2020 (7)
雌雄异花同株能源植物小桐子性别分化的分子基础研究
32-39,8
国家自然科学基金项目(31260041),云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(50097505),云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新项目(51400605)
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