玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析OA北大核心CSTPCD
Genome-Wide Identification of Maize GATA Gene Family and Expression Analysis under Heat Stress
利用生物信息学方法对玉米基因组中的GATA基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、染色体分布、系统进化、基因结构、保守基序进行分析,并分析其在热胁迫前后的表达水平变化,以期为玉米GATA基因功能研究奠定基础.结果表明,在玉米基因组中共鉴定到37个GATA基因,它们不均匀地分布在10条染色体上,均含有CX2 CX18 CX2 C保守基序;进化树分析表明,玉米GATA基因家族可分为A、B、C、D 4组,分别包含21、10、4、2个基因,同一组内的基因具有相似的基因结构.热胁迫处理后,玉米GATA家族成员中表达上调的基因有9个,包含A组5个(Zm00001d010785、Zm00001d023539、Zm00001d041883、Zm00001d025953、Zm00001d031135),B组2个(Zm00001d011771、Zm00001d034751),C组2个(Zm00001d036494、Zm00001d014656);下调的基因有2个,均属于B组(Zm00001d016361和Zm00001d009193).说明上调表达的这9个GATA基因在应答热胁迫过程中可能发挥重要作用.
王延召;周波;韩小花;黄保;鲁晓民;程军玲;王淑凤;聂利红
河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002禹州市农业农村局,河南 禹州 451670河南省农业科学院 经济作物研究所,河南 郑州 450002
农业科技
玉米GATA基因家族全基因组鉴定热胁迫基因表达
《河南农业科学》 2020 (11)
19-25,7
河南省农业科学院重大科技成果培育计划项目
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