解淀粉芽胞杆菌SQR9亲缘识别与辨别相关基因的筛选OA北大核心CSCDCSTPCD
Screening of genes related to kin recognition and discrimination in Bacillus amyloliquefaciens SQR9
[目的]依据不同基因突变体的群集运动表型研究解淀粉芽胞杆菌SQR9中参与亲缘识别和辨别过程的关键基因.[方法]利用带有mariner转座元件的穿梭质粒pMarA,构建菌株SQR9的突变体文库,同时结合实验室已保存突变体,通过Swarming平板对峙表型进行筛选,找到与菌株SQR9和FZB42表型发生变化的突变株.针对Swarming表型变化转座子突变株,利用反筛标记pheS进行基因无痕敲除验证与表型验证.[结果]敲除菌株SQR9的sinR、fliD、flhO和degU基因后影响其亲缘识别野生型亲本菌株的能力.定点敲除菌株SQR9的flhO基因后发现,Swarming表型与Tn转座插入突变体一致,都与野生型菌株SQR9形成边界表型,可能参与亲缘识别过程.敲除spo0A调控基因显著影响菌株SQR9的功能,其与解淀粉芽胞杆菌FZB42的对峙边界表型消失,可能参与非亲缘排斥.[结论]解淀粉芽胞杆菌SQR9中全局性调控基因(spo0A、sinR和degU)、鞭毛蛋白合成相关基因(fliD和flhO)、芽孢萌发基因(gerAA和gerAB)、抗生素合成基因(srfAA)及其他基因(patB和yugK)可能参与菌株SQR9的亲缘识别与辨别系统.
严无瑕;仇美华;刘妍;薛妍生;陶丽丽;徐志辉;沈标;张瑞福;沈其荣
南京农业大学江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物协同创新中心/资源与环境科学学院,江苏 南京210095江苏省耕地质量与农业环境保护站,江苏 南京210029南京农业大学江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物协同创新中心/资源与环境科学学院,江苏 南京210095南京农业大学江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物协同创新中心/资源与环境科学学院,江苏 南京210095南京农业大学江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物协同创新中心/资源与环境科学学院,江苏 南京210095南京农业大学江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物协同创新中心/资源与环境科学学院,江苏 南京210095南京农业大学江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物协同创新中心/资源与环境科学学院,江苏 南京210095南京农业大学江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物协同创新中心/资源与环境科学学院,江苏 南京210095南京农业大学江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室/江苏省有机固体废弃物协同创新中心/资源与环境科学学院,江苏 南京210095
农业科技
解淀粉芽胞杆菌亲缘识别亲缘辨别基因敲除
《南京农业大学学报》 2021 (1)
119-126,8
国家重点研发计划项目(2017YFD0200805)国家自然科学基金项目(31972512)国家自然科学基金青年项目(31801949)泰州市科技支撑计划(农业)项目( yjykj201903)
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