基于TCGA数据库建立胆管癌自噬相关基因预后预测模型及其应用OACSTPCD
Construction of prognosis prediction model for cholangiocarcinoma based on autophagy-related genes of TCGA database and its application
目的 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库构建胆管癌自噬相关基因(ARGs)预后预测模型.方法 通过人类自噬数据库和分子特征数据库获得531个胆管癌ARGs.从TCGA数据库中选择CHOL队列的转录组和临床数据进行下载,包含胆管癌组织36例、正常胆管组织9例.采用Perl软件将原始测序数据进行合并,提取所有ARGs的表达数据;利用R软件对胆管癌组织和正常胆管组织中的ARGs进行差异表达分析,筛选出胆管癌组织中表达失调的ARGs,并进行GO功能富集…查看全部>>
史华帝;左瑜芳;钟富兰;易小琼;徐祖敏
广东医科大学附属医院,广东湛江524000广东医科大学附属医院,广东湛江524000广东医科大学附属医院,广东湛江524000广东医科大学附属医院,广东湛江524000广东医科大学附属医院,广东湛江524000
医药卫生
胆管癌预后风险模型列线图癌症基因组图谱数据库自噬相关基因
《山东医药》 2021 (2)
6-11,6
广东省自然科学基金(2020A1515010048)广东省中医药管理局科研项目(20201179)湛江市非资助科技攻关项目(2019B01021).
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