利用CRISPR/Cas9筛选膀胱癌T24细胞生长必需基因OACSTPCD
A genome-wide CRISPR/Cas9 screen in bladder cancer T24 cells identifies essential growth genes
目的:利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,筛选维持膀胱癌T24细胞正常生长必需基因,为膀胱癌靶向治疗提供新的思路.方法:将人全基因组文库质粒进行扩繁并包装慢病毒,然后感染T24野生型细胞,用嘌呤霉素(puromycin)进行筛选.为了获取T24细胞生长必需基因表达变化情况,分别收集第1天的活细胞作为对照组,培养第14天的细胞作为实验组,分别提取两组细胞DNA,进行全基因组测序和生物信息学分析获得候选基因.对候选基因进行功能注释和通路分析,并结合TCGA数据库进行生存分析,了解这些基因的主要富集通路及对预后的影响.结果:筛选出了971个可能维持膀胱癌细胞正常生长的必需基因,这些基因主要富集在脂质代谢、糖代谢、细胞周期和蛋白质合成等通路中,其中部分基因可能影响膀胱癌预后.结论:本研究对于进一步验证这些基因在膀胱癌T24细胞中的功能和机制具有重要意义.
韦连心;陶玉婷;黄浩轩;冯超;陆钦晨;李天宇;王秋雁
广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,南宁530021广西医科大学基因组与个体化医学研究中心,南宁530021广西医科大学基因组与个体化医学研究中心,南宁530021广西医科大学基因组与个体化医学研究中心,南宁530021广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,南宁530021广西医科大学基因组与个体化医学研究中心,南宁530021广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,南宁530021
医药卫生
生长必需基因CRISPR/Cas9膀胱癌
《广西医科大学学报》 2020 (12)
2117-2122,6
国家自然科学基金项目(No.81760454)广西自然科学基金项目(No.2016GXNSFGA380006,No.2017GXNSFAA198323,No.2019GXNSFAA245097)广西科技开发课题资助项目(No.桂科AD17195090)
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