菠萝NAC转录因子基因AcoNAC1生物信息学及表达分析OA北大核心CSCD
Bioinformatics and Expression Analysis of a NAC Transcription Fac-tor Gene AcoNAC1 in Ananas comosus
NAC转录因子作为植物中数量最大的转录因子家族之一,在植物生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要的调控作用.本研究以菠萝为试验材料,采用RT-PCR技术克隆得到基因AcoNAC1(GenBank登录号:XM_020225830),对其进行生物信息学及表达分析.生物信息学分析表明,该基因cDNA序列全长1723 bp,ORF为1062 bp,编码353个氨基酸,相对分子量为38.34 kDa,理论等电点为8.88;其编码蛋白的二级结构由20.40％的 α-螺旋(H)和15.30％的β-折叠(E)以及59.21％的无规则卷曲(C)组成,具有NAC典型结构保守域.基因表达分析表明,AcoNAC1基因的表达受低温和干旱胁迫诱导,低温胁迫24 h和干旱胁迫12 h时的表达量最高;在不同成熟期品种中表现出持续的诱导表达,但诱导强度逐渐下降,其中早熟品种谢花后20～50 d及晚熟品种谢花后20～60 d基因表达量均处于较高水平.因此,推测AcoNAC1基因可能参与菠萝逆境胁迫响应以及果实发育与成熟的调控.
谭秦亮;周全光;蔡元保;杨祥燕;李穆;李季东;黄思婕;程琴;庞新华;朱鹏锦
广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001广西农垦甘蔗研究所,广西南宁 530001广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001广西农垦甘蔗研究所,广西南宁 530001广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001
农业科技
菠萝NAC转录因子生物信息学分析逆境胁迫
《热带作物学报》 2021 (2)
310-316,7
广西自然科学基金项目(No. 2019GXNSFAA245010)广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科 2020YM55,桂农科2021YT153)广西直属公益性科研院所基本科研业务费专项(桂热研201903).
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