基于生物信息学分析探究盘状红斑狼疮的关键通路、基因及免疫细胞浸润OA北大核心CSCDCSTPCD
Analysis on key signaling pathways, genes and and immune cell infiltration in discoid lupus erythematosus based on bioinformatics
目的:采用生物信息学方法寻找盘状红斑狼疮(DLE)中的差异表达基因(DEGs)和免疫细胞浸润矩阵明确其功能,探讨DLE的发病机制.方法:从GEO中获取GSE81071芯片数据,以P＜0.05及IlogFCl＞ 1.5为条件筛选DEGs;采用CIBERSORT反卷积法分析表达谱中22种免疫细胞浸润比例.结果:共筛选出DEGs 214个,其中上调基因178个,下调基因36个,主要富集于细胞膜外侧面、膜侧和细胞表面,通过调节dsRNA结合、趋化因子受体结合和活性参与免疫应答、固有免疫应答、防御反应等生物学过程.KEGG主要富集细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体、病毒感染等信号通路.PPI网络分析筛选得前2个核心基因STAT1和OAS1.免疫细胞的浸润矩阵分析结果表明,活化的CD4+记忆T细胞、M1巨噬细胞显著增加,而活化的树突状细胞(DCs)显著减少.结论:M1巨噬细胞和CD4+记忆T细胞、DCs的活化与DLE发病机制密切相关,核心基因STAT1和OAS1可能通过细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体等免疫相关信号通路参与DLE发生发展.
魏姗姗;闫璐;邱贤文;赖宽;米向斌
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医药卫生
盘状红斑狼疮免疫细胞生物信息学STAT1
《中国免疫学杂志》 2021 (5)
519-523,528,6
本文为国家自然科学基金青年项目(81803119).
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