乌拉尔甘草CBL基因家族的鉴定与表达分析OA北大核心CSCD
Genome-wide Identification and Expression Analysis of CBL Gene Family in Glycyrrhiza uralensis
钙依赖磷酸酶B类似蛋白(Calcineurin B-like proteins,CBL)是植物特有的一类Ca2+传感蛋白,在植物逆境应答及发育过程中发挥重要作用.为挖掘乌拉尔甘草CBL家族成员特征并预测CBL功能,利用生物信息学方法从乌拉尔甘草基因组中鉴定出10个CBL基因,命名为GuCBL1-GuCBL10,分别定位在10个不同的支架上.氨基酸序列比对发现,CBL家族成员在C-末端都含有4个与钙离子结合的EF-motif,部分CBL成员N端含有肉豆蔻酰化位点及棕榈酰化位点,预测可能与CBL蛋白的亚细胞定位有关.进化树分析显示,乌拉尔甘草CBL基因家族可分为4个亚家族,且各亚族中都包含拟南芥和大豆的CBL基因家族成员,说明它们具有高同源性.在乌拉尔甘草CBL基因的上游序列中,存在一些应答多种激素和逆境的顺式元件,预测CBL基因家族可能具有不同的生物学功能.组织表达分析表明,GuCBL在乌拉尔甘草根、茎和叶片中均有表达,在根中的表达量最高.荧光定量分析显示,在盐、氧化、干旱、高温和低温胁迫下,CBL家族基因受到不同程度的诱导,说明乌拉尔甘草CBL家族基因的表达与逆境胁迫响应之间的密切联系.该研究结果为深入理解CBL基因响应非生物胁迫的调控机制和解析其参与次生代谢物质累积的功能奠定基础.
高玲;王斐;谢双全;陈喜凤;沈海涛;李鸿彬
石河子大学生命科学学院,石河子 832003石河子大学生命科学学院,石河子 832003石河子大学生命科学学院,石河子 832003石河子大学生命科学学院,石河子 832003石河子大学生命科学学院,石河子 832003石河子大学生命科学学院,石河子 832003
乌拉尔甘草CBL基因家族鉴定表达分析非生物胁迫
《生物技术通报》 2021 (4)
18-27,10
兵团科技计划(2018AB012,2020AA005)
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