龙眼体胚发生早期4CL基因家族鉴定与功能分析OA北大核心CSCD
Identification and Functional Analysis of 4CL Gene Family During Early Somatic Embryogenesis in Dimocarpus longan Lour.
为了解龙眼4-香豆酸:辅酶A连接酶(Dl4CL)基因家族的分子特性及生物学功能.采用生物信息学分析方法进行龙眼4CL基因家族的成员鉴定,蛋白结构域及特性、分子进化树、体胚发生过程和组织器官中的表达规律分析以及可能互作的miRNA预测.结果显示,Dl4CL基因家族包含43个成员,分为6个亚家族;不同亚家族成员的基本理化性质包括等电点、相对分子量、氨基酸个数及信号肽有所差别;Dl4CL蛋白均属于非分泌型蛋白,具有多个保守的motif;各成员基因结构特性与进化树中家族成员亲缘关系的远近有关;Dl4CL启动子序列包含大量光响应元件、厌氧诱导响应元件及MYB结合位点,推测Dl4CL家族成员可能参与龙眼生长发育过程中黄酮类物种的生物合成以及色素的积累;Dl4CL可能参与不同胚胎发育过程和不同组织器官的形态建成;43个Dl4CL成员共有10个受miRNA调控,并且不同成员受不同的miRNA靶向调控,推测Dl4CL可能通过与miRNA互作参与体胚发生、响应环境胁迫等过程.研究表明,Dl4CL在龙眼体胚发生早期除了参与木质素的合成之外,还可能参与色素合成、组织器官特异表达等多种生物代谢途径,表现其生物学功能的复杂性.
洪平静;徐小萍;王静宇;陈晓慧;申序;林玉玲;赖钟雄
福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002
农业科技
龙眼4CL基因家族基因鉴定功能分析
《热带作物学报》 2021 (4)
龙眼体胚发生过程中lmiRNA调控靶基因甲基化的作用机制研究
909-919,11
国家自然科学基金项目(No.31572088)福建省高原学科建设经费项目(No.102/71201801101)福建农林大学科技创新专项基金项目(No.CXZX2017314).
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