'六月早'蜜柚叶绿体基因组及其特征分析OA北大核心CSCD
Chloroplast Genome Sequence and Characteristics Analysis of Citrus maxima 'Liuyuezao'
'六月早'蜜柚(Citrus maxima'Liuyuezao')为国内重要的柚品种琯溪蜜柚早熟芽变品种.以'六月早'蜜柚为材料,利用二代测序进行全基因组重测序,从中组装获取叶绿体基因组并对其进行注释.结果表明:组装获得的'六月早'蜜柚的叶绿体基因组全长160186 bp,四分体结构由大单拷贝区(large single copy,LSC)、小单拷贝区(small single copy,SSC)和反向重复区(inverted repeat,IR)组成,3个分区的长度分别为87939、18395、26926 bp.注释得到133个基因,其中包含89个编码基因,37个tRNA和8个rRNA.共识别到31个短串联重复序列,101个SSR位点.将已公开发表的29个芸香科叶绿体基因组使用最大似然法进行系统发育关系的构建,结果表明,'六月早'蜜柚与甜橙(C.sinensis)、柠檬(C.limon)和C.platymamma的亲缘关系较近.
徐世荣;陈燕琼;潘东明;潘鹤立
福建农林大学园艺产品贮运保鲜研究所,福建福州 350002福建农林大学园林学院,福建福州 350002福建农林大学园艺产品贮运保鲜研究所,福建福州 350002福建农林大学园艺产品贮运保鲜研究所,福建福州 350002
农业科技
琯溪蜜柚叶绿体基因组SSR系统发育
《热带作物学报》 2021 (5)
1223-1230,8
福建省科技厅区域发展项目(No.2017N3005)福建省发改委农业"五新"工程项目(闽发改农业[2018]114号)福建农林大学第三批科技创新专项基金项目(No.2017-71).
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