利用WGCNA鉴定甘薯耐盐相关共表达网络及核心基因OA北大核心CSTPCD
Identification of Salt Tolerance Co-expression Modules and Hub Genes in Ipomoea batatas by WGCNA
为了挖掘甘薯耐盐基因,利用不同盐胁迫时间甘薯根系的转录组数据,选取在样本间表达量变异最大的前50％基因(共32147个),进行加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA).结果表明,共构建了20个基因共表达模块,从中筛选出6个与甘薯盐胁迫相关的特异性基因共表达模块.其中,Green模块和Red模块与盐胁迫48 h正相关,Black模块和Yellow模块与盐胁迫12 …查看全部>>
张毅;吴万亿;刘霞宇;张洁;唐锐敏;贾小云
山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷 030801山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷 030801山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷 030801山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷 030801
农业科技
甘薯加权基因共表达网络分析(WGCNA)盐胁迫转录组核心基因
《河南农业科学》 2021 (6)
16-27,12
国家重点研发专项(2018YFD1000705,2018YFD1000700)山西省农业科学院应用基础研究计划项目(YGC2019FZ4)中央引导地方科技发展资金项目山西省自然科学基金项目(201801D121238)山西省重点研发项目(201803D221008-6)山西省新兴产业领军人才项目山西省高等学校科技创新项目(2019L0388)
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