金耳菌丝及子实体的转录组差异分析OA北大核心CSCD
Transcriptome Different Analysis of Tremella aurantialba at Mycelium and Fruiting Body Stages
为探讨金耳菌丝体时期和子实体时期基因表达变化,利用高通量测序技术进行RNA-Seq分析.差异基因分析显示,两个时期共有10 992个差异表达基因,其中在子实体时期上调、下调的基因数分别为9 988和1 004个.GO功能聚类分析显示,差异表达基因主要富集在催化活性、结合、细胞过程、代谢过程、细胞以及细胞组分.KEGG富集分析表明,差异表达基因参与了氨基酸代谢、碳水化合物代谢、脂类代谢这三大代谢通路,相关基因也大多在金耳子实体时期上调表达,说明金耳子实体发育时期需要一系列代谢反应及其它协同调控,这些代谢相关基因可能在金耳子实体发育时期起着重要作用.通过分析金耳菌丝体和子实体时期基因表达情况,得到了大量基因数据,旨为进一步研究金耳子实体发育机理和功能基因奠定重要的基础.
陈正启;余金凤;冯云利;马明;岳万松;郭相
中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,昆明650221中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,昆明650221中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,昆明650221中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,昆明650221中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,昆明650221中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,昆明650221
金耳转录组差异表达基因GO功能pathway分析
《生物技术通报》 2021 (6)
73-84,12
云南省科技项目"食用菌种质资源保藏库扩建"(2018DC030),农业农村部食用菌加工重点实验室项目(20180801-2)
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