3个澳洲坚果MYB蛋白靶基因的克隆与生物信息学分析OA

[目的]为阐明澳洲坚果MYB (v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)蛋白靶基因的功能及分子作用机制提供了科学的理论依据.[方法]基于澳洲坚果转录组数据和RT-PCR方法克隆澳洲坚果MYB蛋白靶基因,并利用生物信息学分析这些基因编码蛋白质的同源性、系统进化、理化性质、亚细胞定位、跨膜域和信号肽.[结果]获得了3个新的澳洲坚果MYB蛋白靶基因MiTOM1、MiTOM2和MiTOM3,GenBank登录号分别为MT319120、MT319121和MT319122.MiTOM1、MiTOM2和MiTOM3都包含典型结构域VHS-ENTH-ANTH,与其它植物来源的TOM蛋白具有极高的序列相似度,与荷花TOM蛋白(XP 010260421.1、XP_010244847.1和XP 010260421.1)的序列相似度分别高达68.93％、75.76％和68.80％.MiTOM1、MiTOM2和MiTOM3蛋白均为亲水性蛋白.MiTOM1可能定位于细胞核,为非分泌蛋白和非跨膜蛋白;MiT-OM2可能定位于细胞质,为跨膜分泌蛋白;MiTOM3可能定位于细胞核或微体,为非分泌蛋白和非跨膜蛋白.蛋白二级结构预测显示,MiTOM1、MiTOM2和MiTOM3二级结构主要含有无规则卷曲和α螺旋.[结论]MiTOM1、MiTOM2和MiTOM3包含TOM家族典型结构域VHS-ENTH-ANTH,可能在澳洲坚果体内物质运输及控制形态发育方面起重要作用.