前胃泌素释放肽ProGRP生物信息学分析及抗原决定簇预测OA北大核心CSCD
Bioinformatics analysis and epitope prediction of pro-gastrin-releasing peptide (ProGRP)
目的:分析预测前胃泌素释放肽(ProGRP)蛋白结构及其抗原决定簇,为抗ProGRP单克隆抗体的筛选及其相应的抗原结合位点的确定提供可靠依据.方法:从NCBI网站获取ProGRP不同亚型的氨基酸序列进行比对分析(Clustalw),运用不同生物信息学软件分析蛋白理化性质(Protparam),跨膜区(TMHMM),二级结构、亲水性、表面可及性、柔韧性和抗原指数(DNAstar Protean),三级结构(Swiss Model)以及抗原决定簇(BepiPred-2.0及ABCpred).结果:ProGRP具有3个同型异构体,属于亲水性蛋白,半衰期为30 h,无跨膜区;ProGRP氨基酸序列中含丰富的二级结构,包括α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲;ProGRP具有5个潜在的抗原决定簇.结论:该研究筛选的抗原决定簇具有较高的准确性,为鉴定ProGRP单克隆抗体结合位点以及小细胞肺癌(SCLC)的诊治奠定了良好的基础.
郭玉凤;张婷;张超;薛振伟;孔晓娜;周小林
中国辐射防护研究院,太原030006中国辐射防护研究院,太原030006中国辐射防护研究院,太原030006中国辐射防护研究院,太原030006中国辐射防护研究院,太原030006中国辐射防护研究院,太原030006
医药卫生
ProGRP生物信息学分析理化性质结构抗原决定簇
《中国免疫学杂志》 2021 (23)
2827-2831,5
本文为中国辐射防护研究院青年科研基金(2018).
评论