基于生物信息学探讨膝骨关节炎与骨质疏松间的作用机制OA

目的 通过生物信息学相关技术并依托相关数据库探讨膝骨关节炎与骨质疏松间的相互影响机制.方法 分别以"osteoporosis"及"knee osteoarthritis"为关键词在相关疾病数据库(Disgenet、TTD、OMIM、Drugbank、Gene-cards)中筛选相关基因,去重后将两组预测靶基因进行映射得到关键靶点,通过string网站获得靶点间相互作用网络,根据节点连接度值筛选出核心靶点并通过DAVID数据库进行GO富集分析及KEGG通路分析.结果 通过相关疾病数据库搜索筛选出与骨质疏松和膝骨关节炎相关靶点分别为875和734个,映射出关键靶点,以节点连接度值≥94筛选出核心靶点26个并导入DAVID数据库获得131项GO富集结果及67条KEGG信号通路.结论 白细胞介素6、胰岛素、白蛋白、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、血管内皮生长因子A等核心靶点通过作用于肿瘤坏死因子、缺氧诱导因子-1、Toll样受体、FoxO、PI3K-Akt等多条特异性信号通路共同影响膝骨关节炎及骨质疏松的发生发展过程,为临床工作中了解两种疾病相关性及治疗方案的选择提供了较科学的理论基础.