基于TCGA数据库筛选与胃癌进展和预后相关的潜在关键基因OA
目的基于生物信息学方法筛选肿瘤微环境(TME)中与胃癌进展和预后相关的潜在关键基因。方法通过对TCGA数据库中胃癌及癌旁正常组织样本的转录组RNA-Seq数据进行生物信息学分析,筛选出在TME中与胃癌患者生存和预后密切相关的基因。通过R语言软件计算胃癌组织样本中基质成份及免疫成份比例,获得基质评分和免疫评分,并分析患者生存率、临床病理特征与基质评分、免疫评分的相关性;采用R语言软件分析获得胃癌组织与癌旁正常组织的差异表达基因(DEGs),并进行K…查看全部>>
刘婷;张红;万亿;李晓宇;任明翰;王斌;田字彬
青岛大学附属医院消化内科,山东青岛266021青岛大学基础医学院、公共卫生学院青岛大学基础医学院免疫学实验室青岛大学附属医院消化内科,山东青岛266021青岛大学附属医院消化内科,山东青岛266021青岛大学基础医学院特种医学实验室青岛大学附属医院消化内科,山东青岛266021
医药卫生
胃肿瘤因子ⅩⅢa膜蛋白质类淋巴细胞,肿瘤浸润基因表达谱计算生物学数据库,遗传学预后生物标记
《精准医学杂志》 2022 (2)
P.120-125,6
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