水稻响应盐胁迫关键转录因子的鉴定OA北大核心CSTPCD
Identification of Key Transcription Factors in Response to Salt Stress in Rice
盐胁迫是影响水稻生产的重要非生物胁迫之一.本研究以盐胁迫条件下的水稻转录组数据为材料,通过HTSeq和DESeq软件分析转录因子在转录组水平上的表达变化.主要结果如下:水稻在盐胁迫1、3和6h三个时间点共有26个相同的差异表达转录因子,通过蛋白互作筛选出14个基因组成的重要模块;重要模块基因GO分析主要富集在ATP结合功能、对胁迫反应的过程以及细胞质膜囊泡组分上,KEGG分析主要富集在内质网蛋白质加工和内吞作用的通路上;同时鉴定出受盐胁迫诱导表达的关键热激转录因子基因0s03g0745000和Os06g0553100.推测这两个基因可能通过调控HSP70基因的转录表达,影响蛋白质折叠和组装,从而在水稻响应盐胁迫的过程中发挥作用.该研究为后续进行水稻遗传改良提供了候选基因,对进一步认识耐盐机制提供科学启示.
张斌;杨昕霞
湖南科技学院湖南省银杏工程技术研究中心,永州425199湖南科技学院湖南省银杏工程技术研究中心,永州425199
水稻关键转录因子盐胁迫蛋白互作转录组
《生物技术通报》 2022 (3)
9-15,7
湖南省自然科学基金项目(2020JJ4030),湖南省创新平台与人才计划(2020NK4222)
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