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基于DNA甲基化鉴定口腔鳞状细胞癌预后生物标志物OA

中文摘要

目的通过生物信息学方法鉴定口腔鳞状细胞癌(OSCC)差异甲基化区域(DMR)中的基因和其生物学特性,并进一步探讨DMRs中的关键基因在预后中的潜在临床应用价值。方法DNA甲基化分析数据集GSE87053下载自GEO数据库。应用R软件对GSE87053行数据归一化和质控后筛选出差异甲基化位点(DMP),并将其聚类以得出DMRs。应用wANNOVAR工具对DMRs行基因注释。通过DAVID数据库行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG…查看全部>>

王婷婷;温凌杜;王子弘;李孔亮;古妍琪;杨宏宇

北京大学深圳医院口腔医学中心,广东深圳518000北京大学深圳医院口腔医学中心,广东深圳518000深圳市宝安妇幼保健院口腔科,广东深圳518000北京大学深圳医院口腔医学中心,广东深圳518000南方医科大学公卫学院,广东广州510000北京大学深圳医院口腔医学中心,广东深圳518000

医药卫生

口腔鳞状细胞癌DNA甲基化基因生物信息学

《医学信息》 2022 (13)

P.28-33,6

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