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核线粒体DNA对线粒体DNA二代测序数据分析的影响OA

Effect of nuclear mitochondrial DNA on analysis of mitochondrial DNA in second generation sequencing data

中文摘要

目的 研究二代测序数据中核线粒体DNA(NUMT)对线粒体DNA(mtDNA)的变异、拷贝数和片段分布的影响.方法 收集20例卵巢癌组织样本,并对其进行mtDNA靶向捕获测序.通过两种不同的比对方式获得包含NUMT和不包含NUMT的测序数据,比较两种测序数据中mtDNA的测序深度、变异数目、突变频率、拷贝数、单倍群和片段分布的差异.结果 本研究发现包含NUMT测序数据的mtDNA测序深度和拷贝数高于不包含NUMT的测序数据(P<0.01,P<0.…查看全部>>

苏丽萍;郭姗姗;刘洋;陈雅婧;朱盈霏;邢金良;郭旭;郭海涛

空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室,陕西西安710032空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室,陕西西安710032空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室,陕西西安710032空军军医大学基础医学院学员二大队,陕西西安710032空军军医大学基础医学院学员二大队,陕西西安710032空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室,陕西西安710032空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室,陕西西安710032空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室,陕西西安710032

医药卫生

核线粒体DNA线粒体DNA二代测序

《医学争鸣》 2022 (3)

肝癌细胞线粒体基因组突变谱系进化及参与代谢表型异质性的作用研究

315-318,324,5

国家自然科学基金(82020108023,81830070)

10.13276/j.issn.2097-1656.2022.03.010

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