利用SSR荧光标记构建37个中国橡胶树栽培品种指纹图谱OA北大核心
Using the SSR Fluorescent Labeling to Establish SSR Fingerprints for 37 Cultivars in rubber tree (Hevea brasiliensis)
以37个橡胶树栽培品种为材料,利用SSR荧光标记技术进行DNA指纹图谱的构建和遗传关系分析,构建我国橡胶树栽培品种的SSR指纹图谱.共计筛选和确定出34对SSR引物作为构建橡胶树品种DNA指纹图谱库的核心引物,其中30对SSR引物可用于品种鉴定,4对SSR引物可作为备选引物用于后续新选育品种的鉴定.筛选和确定出的核心SSR引物表现出较高的多态性信息含量(PIC值),其中PIC值高于0.5的引物高达97％,PIC值大于0.7的引物多达12对,PIC值大于0.8的引物有2对.引物rbm28的多态性最高,可作为最佳引物用于鉴定中国橡胶树主栽品系的遗传多样性,其他4条引物HESR025、HESR163、H-084、H-122同时具备较高的杂合率和多态性,可考虑作为备选引物.34对核心SSR引物在37个橡胶树品种中共检测到161个等位变异,平均每对引物检测到5.4个等位基因,平均PIC值为0.65,表现出高度多态性.利用30对核心SSR引物对37份橡胶树品种进行扩增,得到相关品种的准确SSR位点信息,获得包含37个橡胶树品种的标准DNA指纹图谱库,其中33个橡胶树品种均具有唯一的DNA特征指纹,可作为各品种特定的图谱,为橡胶树品种鉴定和育种实践提供依据.
位明明;黄肖;李维国;黄华孙
中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口571101中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口571101中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口571101中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口571101
农业科技
巴西橡胶树品种鉴定SSR荧光标记DNA指纹图谱
《热带作物学报》 2022 (8)
1565-1576,12
橡胶品种SSR数据库建设与完善项目(No.19200035)国家天然橡胶产业技术体系项目(No.CARS-34).
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