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基于不同密度SNP面板的凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性分析OA

Genomic prediction accuracy analysis of AHPND resistance genome prediction in Litopenaeusvannameiusing SNP panels with different densities

中文摘要

为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响,本实验对26个全同胞家系进行VpAHPND侵染,收集686尾个体的存活时间数据,对其中242尾个体利用液相芯片"黄海芯1号"(55.0 K SNP)进行基因分型,基于A、G和H亲缘关系矩阵估计VpAHPND侵染后存活时间的遗传参数;采用随机和等距抽取方式,基于55.0 K SNP构建了8个低密度SNP面板(40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.…查看全部>>

刘杨;曹家旺;陈宝龙;孔杰;栾生;刘绵宇;李旭鹏;孟宪红;罗坤;隋娟;谭建;代平

湖州师范学院生命科学学院,浙江湖州 313000中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛 266071

农业科技

凡纳滨对虾AHPND低密度SNP面板基因组预测准确性

《水产学报》 2023 (1)

163-172,10

国家重点研发计划(2022YFD2400202)中国水产科学研究院科技创新团队项目(2020TD26)海南省院士创新平台科研专项(YSPTZX202104)恒兴南美白对虾育种中心(2021E05032)现代农业产业技术体系专项(CARS-48)

10.11964/jfc.20221113779

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