基于生物信息学分析胰腺癌肿瘤浸润性白细胞组成和预后相关的免疫基因OA北大核心CSTPCD
Analysis of tumor-infiltrating leukocyte compositions and prognostic immune-related genes in pancreatic cancer based on bioinformatics
目的:鉴定胰腺癌(PC)浸润性白细胞组成和预后相关的免疫相关基因(IRGs),为患者预后预测提供依据.方法:根据TCGA和GTEx数据库,研究PC和正常胰腺组织中白细胞组成的差异,并分析178例PC患者中差异表达的与OS相关的IRGs.利用计算生物学的方法分析这些IRG的潜在作用机制和性质.采用多变量Cox分析探寻新的PC预后生物标志物.结果:与非肿瘤组织相比,PC组织中CD4+记忆性T细胞和M0巨噬细胞更为常见且占优势.功能富集分析表明,OS相关的差异表达IRGs积极参与了PI3K-Akt信号通路.12个预后相关差异表达的IRGs可用于预后预测.结论:筛选出12个PC特异性IRGs,可作为预测预后的新指标.
滕步伟;杨雨翰;郭增亚;张坤东;王晓峰;陈伟伟;裘正军
南京医科大学康达学院第一附属医院暨连云港市第一人民医院,连云港222061上海交通大学附属上海市第一人民医院,上海200080上海交通大学附属上海市第一人民医院,上海200080上海交通大学附属上海市第一人民医院,上海200080上海交通大学附属上海市第一人民医院,上海200080上海交通大学附属上海市第一人民医院,上海200080上海交通大学附属上海市第一人民医院,上海200080
医药卫生
胰腺癌免疫基因组学肿瘤基因组图谱预后指数生物信息学
《中国免疫学杂志》 2022 (22)
miR-301a在缺氧诱导胰腺癌EMT中的功能机制研究
2740-2746,7
本文受国家自然科学基金项目(81372640)连云港市第一人民医院青年英才基金课题项目(QN1904)南京医科大学康达学院科研发展基金课题项目(KD2020KYJJYB046)资助.
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