铁冬青叶绿体全基因组及系统进化分析OA

铁冬青(Ilex rotunda)是具有多种应用价值的植物,为丰富其分子生物学信息及进一步明确系统位置,应用Illumina Novaseq 6000测序平台对其叶绿体基因组进行测序,组装获得了完整叶绿体基因组;并进行了基本特征分析、SSR特征分析,同时基于同源蛋白序列构建了包括铁冬青在内的33个物种的系统发育树。结果表明:(1)铁冬青叶绿体基因组大小为157,778 bp,其中IRs长度为26,124 bp,LSC长度为87,092 bp,SSC长度为18,438 bp,全基因组GC含量为37.70%,共编码131个基因;(2)共检测到131个SSR,其中大多数为单核苷酸SSR,共120个,占总体的91.60%;(3)系统发育分析表明铁冬青隶属于冬青亚属(Subgen.Ilex)单序冬青组(Sect.Lioprinus),与毛冬青(I.pubescens)和网脉多脉冬青(I.polyneura)亲缘关系较近。研究结果可为冬青科种质资源的鉴定,叶绿体基因组的利用及后续研究等提供理论依据。