植物体内RNA二级结构探测方法的研究进展OA
Research Progress in the Approaches to in vivo RNA Secondary Structure Profiling in Plants
生物体内的RNA因氢键等作用配对折叠形成复杂的二级结构及三级结构,并根据环境产生动态变化,由此行使功能.植物中的基因表达调控及配体感应都与RNA的结构相关,RNA结构也被认为是转录后调控的一项影响因素,RNA的结构对与之互作的蛋白的结构和功能产生影响,因此研究RNA功能过程中解析RNA结构尤为关键.目前,RNA二级结构的探测实验方法从X-射线经过酶切及化学探针标记,发展至结合高通量测序即可建构模型.此外,机器学习等方法也为RNA结构的探测提供了新的思路.本文综述了影响体内RNA结构的因素及近年来用于植物体内RNA结构预测的方法,讨论了现有方法的应用限制下对RNA二级结构预测新方法开发的意义及存在的问题,展望计算机预测方法与实验方法未来的发展趋势,旨为后续RNA结构相关研究提供方法参考.
周晞雯;成柯;朱鸿亮
中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京 100083中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京 100083中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京 100083
RNA结构二级结构探测方法植物生理
《生物技术通报》 2023 (2)
富含甘氨酸的RNA结合蛋白SlGRP7对番茄果实成熟及品质形成的调控机制研究
51-62,12
国家自然科学基金项目(31972472)
评论